按照“感思系统→符号系统→器物系统”的文明思脉，坚持“哲学化牵引→公理化完善→数学化实现”的创新思路，在气候海洋学基础上，以结构海洋学为核心、以仪器海洋学为突破、以工程海洋学和军民融合海洋学为应用实现，进行以流、波、湍三象性为主线的海洋与大气研究。通过现场调查，形成海洋感知，融合应用需求，涌现推断假设，经由检验确认，实现理论创新和产品转化。基本勘遍中国海区及邻域，绘制《中国海区及邻域环流系统图》，出版《黑潮特征参考图集》；开辟结构海洋学研究道路，构建地转流、内孤立波结构单体，形成调查资料三线控制式处理方法，突破LADCP深海观测资料处理的国际困局，提出海洋跃层的五点三要素定义法和全水层谱表达法；研制一脚踹、内波仪等原创技术装备；主设我国最大海洋军民融合专项，2019年获习大大总书记签批实施；引导硕士生30余名、博士生3名，发表论文50余篇，主持项目70余项，出版专著、图集3部，获发明专利9项。
发表文章
1. 《黑潮特征参考图集》; 中国航海图书出版社; 2016; 熊学军, 胡筱敏, 于龙, 鞠霞.
2. 《中国近海海洋-物理海洋与海洋气象》; 海洋出版社; 2012; 熊学军等.
3. 《中国近海海洋图集-物理海洋与海洋气象》; 海洋出版社; 2012; 熊学军等.
4. EMD方法和Hilbert谱分析法的应用与探讨;黄渤海海洋;2002，20(2), 12-21;熊学军, 郭炳火, 胡筱敏, 刘建军.
5. LADCP观测和资料后处理的关键技术；海洋技术；2003, 22(4), 32-36；熊学军, 郭炳火, 胡筱敏.
6. 利用漂流浮标资料对黑潮及其邻近海域表层流场及其季节分布特征的分析研究；海洋学报；2008, 30(6),1-16;胡筱敏, 熊学军, 乔方利, 郭炳火, 林霄沛.
7. 渤海夏季第一斜压罗斯贝变形半径的计算与分析;海洋科学进展; 2015,33(3), 295-304;张晓璐, 熊学军*.
8. 海洋跃层的谱表达法及自适应识别;海洋科学进展;2016, 34(3), 328-336;陈亮, 熊学军*, 李小龙, 苏劼.
9. 黄海暖流抵近青岛近海分支的确认及形态结构特征;中国科学：地球科学;2019,49(7),1013-1115;熊学军, 胡筱敏, 郭延良, 于龙, 陈亮, 云升军, 薛宇欢.
10. A new type of internal solitary waves with a re-appearance period of 23 h observed in the South China Sea; Acta Oceanologica Sinica, 2018, 37(9), 116-118. Liang Chen, Quanan Zheng, Xuejun Xiong*. Yeli Yuan, Huarong Xie.
11. Dynamic and Statistical Features of Internal Solitary Waves on the Continental Slope in the Northern South China Sea Derived From Mooring Observations; Journal of Geophysical Research: Oceans, 2019, 124(6), 4078-4097; Chen Liang, Zheng Quanan, Xiong Xuejun*, Yuan Yeli, Xie Huarong, Yu Long, Yun Shengjun.
12. Existence, morphology and structure of the Yellow Sea Warm Current Branch approaching waters offshore Qingdao, China; Science China Earth Sciences, 2019, 62(7), 1167-1180; Xuejun Xiong, Xiaomin Hu*, Yanliang Guo, Long Yu, Liang Chen, Shengjun Yun,Yuhuan Xue.
13. Mooring observed mode-2 internal solitary waves in the northern South China Sea; Acta Oceanologica Sinica, 2020, 39(11), 44-51; Liang Chen, Xuejun Xiong*, Quanan Zheng, Yeli Yuan, Long Yu, Yanliang Guo, Guangbing Yang, Xia Ju, Jia Sun, Zhenli Hui.
14. Synoptic time-scale variability of sediment temperature profile and sound speed in shallow seas derived from in situ observations; Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2020, 244, 106-117; Guangbing Yang, Quanan Zheng, Xiaomin Hu, Dejing Ma, Zhao Chen, Long Yu, Xia Ju, Zhanpeng Zhuang, Zhenli Hui, Yan-Liang Guo, Jia Sun, Liang Chen, Yeli Yuan, Xue-Jun Xiong*.
15. Estimating the Absolute Salinity of Chinese offshore waters using nutrients and inorganic carbon data; Ocean Science,2021,17,909–918；Fengying Ji, Rich Pawlowicz, Xuejun Xiong*.
获奖与荣誉
1. 《黑潮特征参考图集》, 海洋优秀科技图书奖, 2018.11, 国家海洋局、中国海洋学会、中国太平洋学会和中国海洋湖沼学会, 1/4
2. 崂山拔尖人才，2021.8.7
3. 山东省优秀研究生引导教师，鲁教研函[2021]11号，2021.9.29
主持项目
1. 2014.1-2017.12，国家自然科学基金：黄海暖流的多时相特征及其发生机制研究，85万元，主持
2. 2015.1-2019.12，工业和信息化部：内波流预警方案研究及内波流监测系统研制，1100万元，主持
3. 2016.1-2020.12，国家科技重大专项科研任务：南海北部内波流监测、预报、预警系统研究及应用（2016ZX05057015），5537.04万元，主持
4. 2017.1-2020.12，国家专项，东海水体调查，3712万元，主持
5. 2019.1-2022.12，国家专项：海洋调查通信链路建设，6000万元 ，主持
